Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti nel 2026 nel depuratore di Castiglione Torinese

Gennaio

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane  2, 3, 4 e 5 del 2026.

Le varianti dominanti 

Dalla settimana 4 del 2026, sono comparse, a bassa frequenza, RE.2, RE.1 ed RE.1.1 (rispettivamente BA.3.2.2.2, BA.3.2.2.1, BA.3.2.2.1.1), che sono sottovarianti di BA.3.2 (Cicada), la quale è state classificata come “Variant Under Monitoring” (VUM) dal WHO (World Health Organization) dal 5 dicembre 2025. 

 _{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di gennaio 2026}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 risulta essere così illustrato

Febbraio

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane  6, 7, 8 e 9 del 2026.

Le varianti dominanti 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella che segue. Si tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25C per XFG e al clade 25I per BA.3.2.2.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di febbraio 2026}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 risulta essere così illustrato

Marzo

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane  10, 11, 12, 13 e 14 del 2026.

Le varianti dominanti 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella. Si tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25I.

^{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di marzo 2026}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 risulta essere così illustrato

Aprile

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane  15,16,17 e 18 del 2026.

Le varianti dominanti

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella. Si tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25I.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di aprile 2026}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La figura seguente mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 risulta essere così illustrato

Maggio-Giugno

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane 19-20-21-23-25-26-27/2026. Per problemi di carattere tecnico, i campioni delle settimane 22 e 24 non sono stati sequenziati.

Le varianti dominanti

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella 1. 

_{Tabella 1. Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di maggio-giugno 2026}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La figura 2 mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti

Nelle Figure 3 e 4 e nella Tabella 2 sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. 

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi degli ultimi sei mesi è illustrato nella figura 5A.
L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 è illustrato nella figura 5B. 

_{Riferimenti analisi bioinformatica:} 

• _{Nextclade (version v3.21.2)}
• _GISAID
• _{Freyja version 1.5.2, barcode 07_06_2026-00-59 (https://github.com/andersen-lab/Freyja/blob/main/LICENSE)}