Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti nel 2025 nel depuratore di Castiglione Torinese

Gennaio

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 2, 3, 4 e 5 del 2025. 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 per il depuratore di Castiglione Torinese, dalla settimana 2 del 2025 alla 5 del 2025, sono elencate nella tabella che segue. Si tratta di una sottovariante ricombinante di Omicron.

^{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di gennaio 2025}

La figura che segue mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 10 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

La variante LP.8.1 (clade 25A) è stata classificata dal WHO come “Variant Under Monitoring” (VUM) in data 24/01/2025.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 36 del 2024 risulta essere così graficato 

Febbraio

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 6, 7, 8 e 9 del 2025. 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 per il depuratore di Castiglione Torinese, dalla settimana 06 alla 09 del 2025, sono elencate in tabella. Si tratta di una sottovariante ricombinante di Omicron.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di febbraio 2025}

La figura che segue mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 10 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 36 del 2024 risulta essere così graficato 

Marzo

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 10,11,12,13 e 14 del 2025. 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 per il depuratore di Castiglione Torinese, dalla settimana 10 alla 14 del 2025, sono elencate in tabella. Si tratta di una sottovariante ricombinante di Omicron.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di marzo 2025}

La figura che segue mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 14 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 36 del 2024 risulta essere così graficato 

Aprile

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 15,16,17 e 18 del 2025. 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 per il depuratore di Castiglione Torinese, dalla settimana 15 alla 18 del 2025, sono elencate nella tabella. Si tratta di sottovarianti di Omicron.

 Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di aprile 2025

La figura seguente mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 36 del 2024 risulta essere così graficato 

Maggio e giugno

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25 26 e 27 del 2025. 

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2, sono elencate nella tabella. Si tratta di sottovarianti di Omicron.

^{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di maggio e giugno 2025}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La figura seguente mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. La variante ricombinante di Omicron NB.1.8.1 (“Nimbus”, clade 25B) è stata designata come VUM dal WHOI il 23.05.2025, mentre la variante ricombinante di Omicron XFG (clade 25C) è stata designata come VUM dal WHO il 25.06.2025.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 36 del 2024 risulta essere così graficato 

Luglio e agosto

Le varianti dominanti 

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane 28-30-31-32-33-34-35 del 2025. 

Il campione della settimana 29 del 2025 verrà processato prossimamente a seguito di un problema analitico.

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella 1. Si tratta di sottovarianti di Omicron.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di luglio e agosto 2025}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. La variante ricombinante di Omicron XFG (“Stratus”, clade 25C) è stata designata come VUM dal WHO il 25.06.2025.

Andamento dei macro-lignaggi raggruppati

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 risulta essere così graficato 

Settembre e ottobre

Le varianti dominanti 

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane 29-36-37-39-40-41-42-43-44 del 2025

Il campione della settimana 38/2025 verrà processato prossimamente a seguito di un problema analitico.

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella 1. Si tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25C.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di settembre ed ottobre 2025}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. La variante ricombinante di Omicron XFG (“Stratus”, clade 25C) è stata designata come VUM dal WHO il 25.06.2025.

Novembre

Le varianti dominanti 

Analisi di sequenziamento del virus SARS-CoV-2 in campioni di acqua reflua del depuratore di Castiglione Torinese, riferiti alle settimane 38-44-45-46-47-48 del 2025

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 sono elencate nella tabella 1. Si tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25C.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di settembre ed ottobre 2025}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. La variante ricombinante di Omicron XFG (“Stratus”, clade 25C) è stata designata come VUM dal WHO il 25.06.2025.

Dicembre

Le varianti dominanti 

Campioni acqua reflua delle settimane 49, 50, 51 e 52 del 2025 e prima settimana del 2026-

Le varianti dominanti di SARS-CoV-2 per il depuratore di Castiglione Torinese sono elencate in tabella. SSi tratta di sottovarianti di Omicron appartenenti al clade 25C.

_{Varianti di SARS-CoV-2 dominanti nel periodo di dicembre 2025}

Nella figura che segue sono riportate, in sintesi, le varianti dominanti di SARS-CoV-2 individuate in ciascuna settimana per il depuratore di Castiglione Torinese:

La prossima figura mostra, nel dettaglio, l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla 49sima settimana del 2021 con cadenza settimanale per i 4 depuratori analizzati (Castiglione Torinese, Alessandria, Cuneo, Novara). Per ogni settimana, fino alla settimana 18 del 2024, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte. Dalla settimana 11 del 2024 si è monitorato unicamente il depuratore di Castiglione Torinese.

Le varianti non dominanti 

Nelle prossime figure e  tabella  sono riportate le sottovarianti di Omicron per il depuratore di Castiglione Torinese e la loro abbondanza relativa, la quale definisce la proporzione che tali varianti rappresentano sul totale delle varianti presenti. 

ANDAMENTO DEI MACRO-LIGNAGGI RAGGRUPPATI

L’andamento dei macro-lignaggi dalla settimana 45 del 2024 è illustrato nella figura seguente

Riferimenti analisi bioinformatica: 

• Pangolin (version v4.3, pangolin-data version v1.22)
• Nextclade (version v3.18.0)
• GISAID
• Freyja version 2.0.2, barcode 31_12_2025-00-39 (https://github.com/andersen-lab/Freyja/blob/main/LICENSE)