Sequenziamento acque reflue: dominante la sottovariante Kraken ma presenti più sottovarianti

Nella 21° settimana, relativa ai campionamenti del 22 maggio 2023, per i depuratori di Castiglione Torinese e Novara e nella 22° settimana, relativa ai campionamenti del 29 maggio 2023, per il solo depuratore di Castiglione Torinese (dati del depuratore di Cuneo attualmente non disponibili), si ha la dominanza della sottovariante XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A).

Per gli altri depuratori analizzati, l’analisi bioinformatica ha evidenziato i seguenti conflitti per l’assegnazione della variante dominante:

-          Settimana 21: Alessandria (XBB.1, XBB.1.5); Cuneo (XBB.1.22 (Bellatrix), XBB.1.5);

-          Settimana 22: Alessandria (XBB.1.22, XBB.1.9.1 (Hyperion));    Novara (XBB.1.22, XBB.1.5).

Di seguito sono riportate le tabelle descriventi le sottovarianti di Omicron ritrovate con bassa frequenza per ciascun depuratore.

Non si osservano mutazioni specifiche ed univoche per la sottovariante Omicron BA.3.

Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.