Sequenziamento acque reflue: le varianti dominanti a luglio 2023 nei depuratori del Piemonte
Nella 27° settimana del 2023 relativa ai campionamenti del 3 luglio, per il depuratore di Alessandria la variante dominante è XBB (Gryphon- Clade 22F); per il depuratore di Novara la variante dominante è XBB.1.5 (Kraken- Clade 23A); per il depuratore di Castiglione Torinese e di Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante: per Castiglione torinese il conflitto è tra le sottovarianti XBB.1.22 (Bellatrix) e XBB.1.5 e per il depuratore di Cuneo tra le sottovarianti XBB.1 (Hyppogryphon), XBB.1.22, XBB.1.5, XBB.1.9.1.
Nella 28° settimana del 2023 relativa ai campionamenti del 10 luglio, per il depuratore di Alessandria la variante dominante è EG.1; per il depuratore di Castiglione Torinese, Cuneo e Novara l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante: per Castiglione torinese il conflitto è tra le sottovarianti XBB.1.22 e XBB.1.5, per il depuratore di Novara tra XBB.1, XBB.1.5 e XBB.1.5.59 e per il depuratore di Cuneo tra le sottovarianti XBB.1.22, XBB.1.5, XBB.1.9.1.
Nella 29° settimana del 2023 relativa ai campionamenti del 17 luglio, per il depuratore di Alessandria e Novara la variante dominante è XBB.1.16 (Arcturus- Clade 23B), per il depuratore di Castiglione Torinese è XBB.1.9.1; per il depuratore di Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti XBB.1.5 e XBB.1.9.1.
Nella 30° settimana del 2023 relativa ai campionamenti del 24 luglio, per il depuratore di Alessandria la variante dominante è XBB.1.9.2, per il depuratore di Castiglione Torinese e di Novara è XBB.1.22 (Bellatrix), per il depuratore di Cuneo l’analisi bioinformatica ha evidenziato un conflitto per l’assegnazione della variante dominante tra le sottovarianti EG.5, EG.5.1 (Eris-Clade 23F), XBB.1.5, XBB.1.5.24 e XBB.1.9.2.
EG.5 (XBB.1.9.2.5) e le sue sottovarianti sono state inserite nella lista della “Variants Under Monitoring (VUMs)” del WHO il 19.07.2023 e riclassificate come “Variants Under Interest (VOIs) il 09.08.2023.
Il grafico mostra nel dettaglio l’alternanza delle sottovarianti dominanti di SARS-CoV-2 identificate in Piemonte a partire dalla settimana 49 del 2021 con cadenza settimanale per i quattro depuratori analizzati. Per ogni settimana, alla dominanza di ciascun depuratore è stato associato il valore di ¼, che ha permesso di monitorare la variazione della dominanza complessiva nella regione Piemonte.
